办公室

　　负责院中、长期事业发展规划、体制改革、内部审计、全院综合性规章制度和归口管理全院的规章制度和管理办法的制定及文秘、档案、保密等工作，负责对外联系并协调处理日常事务。

党委办公室

　　按规定管理院管干部，负责院的精神文明建设工作、政治理论学习、党的方针政策宣传、基层组织建设及法制教育等工作，负责党风廉政建设。负责党、政会的会务组织工作。负责离、退休干部职工的管理工作。

人事教育处

　　负责制订院人才发展规划和人力资源开发、培养、教育、优化配置等工作的规划、计划和措施，负责院深化干部人事制度、分配制度的改革方案的起草工作，负责人事和劳动工资管理，组织职工教育、继续工程教育和职称评定工作，负责全院干部、职工的管理工作。负责全院计划生育工作和无偿献血组织工作。

科研管理处

　　负责制订院科研和技术开发工作的规划和计划，负责研究和开发项目的质量和过程管理，负责制订科研、技术开发工作的规章制度和管理办法，科研成果管理，项目合同管理，科技合作与交流，科技统计、科研经费管理与核算等履行部门职责要求的组织协调与实施，承办科技交流工作和院学术委员会办公室的日常工作。

经营开发处

　　负责制订院经营开发工作的规划与计划，以及经营开发项目的立项、组织实施及管理；负责院属企业资产监管，组织策划院属企业和参股公司的筹建和退出等；负责资本运作及院属公司的机制转换，制定公司转制方案并组织实施；制定市场开发战略；负责公司资产及资源监督；负责公司管理中的相关法律问题，依法维护院及公司的权益。

财务处

　　负责制订院财务管理规章制度；负责对院的经营活动进行定期财务分析，为院的经营决策提出建议和措施。

科研条件处

　　负责组织和制订院基本建设、改造等项目的规划、年度计划、项目前期工作的编制、申报及项目的过程管理；负责组织制订院实验室建设与改造、实验室设备更新等项目的规划、年度计划并组织实施；负责院实验室建设、管理、运行相关规章制度的编制及对实验室建设的全过程进行监督、检查；负责制订和组织实施本院的资产管理规章制度和工作计划；负责本院占有和使用资产的统一管理、购置、验收、报损、报废的审核及报批处理工作；负责房改工作。

交通科技管理中心

　　承担交通科技项目的立项申请，项目评审和论证，对项目执行情况的监督、检查，项目验收鉴定和经费管理，科技成果的统计和推广，交通科技项目信息发布和相关网站的维护，交通部重点实验室评估工作。

物业管理中心

　　负责交通安全、社会治安综合治理、人防、绿化等具有行政职能的工作和后勤服务工作。

交通发展研究中心

　　 从事交通行业发展战略研究，从事交通发展规划编制和重大项目的投资经济分析、项目可行性等研究，开展交通行业法规和体制创新研究，从事综合运输和物流管理等研究，跟踪和研究国外交通发展动向。

信息资源研究室

　　承担交通文献资源的采集、加工、存储及服务；交通电子图书馆、有关信息库及网上信息资源开发、建设和服务；为部机关电子政务及政府网络化信息系统建设提供相关服务与技术保障。

标准计量研究所

　　承担交通行业标准化基础理论、技术政策研究；研究制定行业标准化体系；制（修）订交通行业国家标准、行业标准（主要承担基础性、综合性部分）；行业标准化编辑审查及管理工作，技术标准宣贯、推广及中介服务。承担公路、水运工程计量检定站的建设及检定业务，制（修）订交通行业计量法规及技术政策的研究，计量技术科研以及计量技术检测、中介服务、计量员培训等工作。

交通信息中心

　　承担交通行业综合性信息的研究、开发，统计资料编辑，交通基础设施普查、统计分析及交通行业信息资源的整合与数据交换；为交通行业与社会提供信息服务。

　　负责交通运输规划、公路网规划、公路枢纽、运输战场规划和研究，承担面向交通事业发展的技术咨询、技术开发、技术推广等工作。

　　从事交通行业环境保护与安全的法规政策研究，从事交通噪声防治、船舶污染防治、交通运输中突出环境问题等环境保护技术研究，从事寒冷、干旱等恶劣气候下及高陡、硬实边坡等难绿化区域的植被建植技术等研究，从事保护和恢复自然景观、创造和利用公路景观等方面的设计技术研究，从事与危险品运输有关的安全平价、安全保障和劳动保护等技术研究。

国家船舶舱容积计量站

　　负责承担全国5000吨以下油轮舱容检定工作，船舶容量计量检测技术培训、咨询服务和技术研究。

　　承担以社会效益为主体的技术交易服务和交通科技成果的推广；开拓交通技术市场，组织交通科技交易活动，举办交通技术交流会、交易会、展览会；开展国际交通技术交流和贸易服务。

　　开展面向全社会的交通技术培训、素质培训、技能培训和专业知识培训。

　　承担交通信息化基础技术研究，物流信息技术、信息服务支持技术、交通应用信息基本系统的研究开发，信息传媒技术研究和开发，信息化标准与规范研究。

交通可持续发
展研究中心

　　负责中国可持续交通发展战略、中国城市可持续发展交通政策研究、交通环境与能源政策研究现代空间信息技术在交通领域的开发应用研究。

现代物流研发中心

　　负责车辆监控管理及调度信息系统（GPS/GSM/GIS技术集成应用）与相关产品（智能行车记录仪、智能运输卡等）的技术开发和市场推广，面向供应链一体化的物流信息平台的建设与运营；负责现代物流信息技术与产品的研究、开发和市场推广，交通行业物流信息相关标准化推广工作，现代物流与交通信息技术咨询与信息服务；承担智能交通信息技术的研究、开发与市场拓展工作；承担交通运输与管理行业信息、通信、物流网络的设计、技术开发、建设和运营工作；承担交通系统视频会议、远程教育及其它基于宽带互联网技术的多媒体信息技术开发与应用推广工作。承担交通政务信息化系统设计与建设工作。

交通财政与金融研究所

　　跟踪国家财政、税收、金融政策，国内外财政、税收、金融形势和发展动向；开展国家财政金融政策改革对交通行业的影响和对策研究；开展财政性基金、交通规费征收和使用管理的研究；开展交通行业投融资、资产管理理论和政策研究；开展交通金融创新研究；交通财会信息系统的开发和应用研究；为政府和各级交通运输管理部门提供财政金融决策支持服务；为交通企业提供金融产品方案设计咨询等服务。

国际培训部

　　承担面向交通事业发展的国际技术咨询、技术开发、技术推广等工作。　

交通生态与景观工程技术中心

　　开展交通生态与景观工程设计咨询；跟踪国内外生态与景观工程技术的发展；提升交通生态与景观工程技术水平，为交通行业做好服务。

交通工程检测中心

　　承担交通工程所用产品、设施、材料和实验检测设备的检测工作，为交通工程设施竣工验收提供试验检测数据；开展交通工程检测相关关键技术的研究。